Η επιχείρηση ιδρύθηκε το 1980 στο Καλαμπάκι Δράμας, από τον Ισαακίδη Μιχαήλ, τον σημερινό πρόεδρο της εταιρείας και κατά κύριο λόγο εμπορευόταν καυσόξυλα.

Αρχικά, η εταιρεία αυτή ξεκίνησε έχοντας τη μορφή ατομικής επιχείρησης, μέχρι το 1999 όπου μετατράπηκε σε οικογενειακή, αφού εισχώρησαν στην επιχείρηση και οι υιοί του Ισαακίδη Μιχαήλ, Δημήτριος, Νικόλαος και Χαράλαμπος Ισαακίδης. Με τον τρόπο αυτό η εταιρεία πραγματοποίησε ένα τεράστιο άλμα προόδου, με αποτέλεσμα να πρωτοπορεί μέχρι και σήμερα, στην προμήθεια ξύλινων στύλων σε μεγάλες δημόσιες επιχειρήσεις, όπως στη Δ.Ε.Η. και στον Ο.Τ.Ε..

Η επιτυχία της εταιρείας συνεχίστηκε και το 2004 παίρνει τη μορφή της Ομόρρυθμης Εταιρείας με την επωνυμία «ΑΦΟΙ ΙΣΑΑΚΙΔΗ Ο.Ε.».

Την τελική και σημερινή της μορφή, την πήρε μόλις το 2007, όπου λειτουργεί πλέον ως Ανώνυμη Εταιρεία «ΙΣΑΑΚΙΔΗΣ Α.Β.Ε.Ε.»